О событиях в монастыре нам рассказывает Chronicon Vulturnense, рукописный кодекс, составленный в 1130 году монахом по имени Джованни, который, в свою очередь, использовал внутренние источники монастыря VIII-XI веков. Основание, согласно Chronicon, датируется началом VIII века и связано с тремя благородными беневентанцами — Пальдо, Тасо и Тато, которые искали место для уединённой аскетической жизни. Выбранная территория была обитаема ещё в позднеримскую эпоху, о чем свидетельствуют остатки церкви и кладбища V-VI века нашей эры.
Особенно важным моментом для монашеской общины был 787 год, когда Карл Великий поместил монастырь под свою прямую защиту, издав привилегию, включающую налоговые и судебные льготы, а также разрешение общине избирать собственного аббата без вмешательства других церковных властей.
Значение аббатства обусловлено его положением на границе лангобардского княжества Беневенто и земель, завоеванных франками. Это подчёркивается в 849 году, когда после раздела княжества Беневенто на территории, подчинённые Салерно и Беневенто, монастырь Сан-Винченцо-аль-Вольтурно остаётся автономной единицей, напрямую подчинённой императорской власти.
Тяжёлым временем для монашеской общины стала вторая половина IX века из-за движений сарацинов, кульминацией которых стала атака в октябре 881 года, завершившаяся пожаром, серьёзно повредившим киновию. После этого события выжившие монахи были вынуждены укрыться у лангобардских князей Капуи.
Восстановление монастыря начнётся лишь в конце X века при поддержке немецких императоров Оттона II и Оттона III. К концу XI века, из-за норманнской угрозы, киновия переносится на правый берег Вольтурно в более безопасное и укреплённое место (так называемый «Сан-Винченцо Нуово»).
В XIII-XV веках начинается упадок и распад монастырского комплекса и его земельных владений (распространяющихся в районе Молизе, Абруццо, Лацио, Кампании, Базиликаты и Апулии), которые в 1699 году по воле последнего аббата Иннико Караччоло переходят под юрисдикцию Аббатства Монтекатчино.
