Das Kartäuserkloster Valsainte bestand aus 12 Zellen, die sich um die Kirche und den Friedhof gruppierten. Es hatte eine aktive Lebensdauer von 5 Jahrhunderten und als es am Ende des Mittelalters unter die Herrschaft von Freiburg kam, begann eine sehr bewegte Zeit aufgrund wiederholter Eingriffe der weltlichen Macht in religiöse Angelegenheiten.
Nach der Reformation floh der Bischof von Lausanne, seines Doms beraubt und aus seiner Stadt vertrieben, nach Freiburg, wo er ohne Mittel blieb. Rom forderte die Regierung von Freiburg auf, zu seinen Gunsten einzugreifen; diese antwortete dem Heiligen Stuhl, eines der beiden Kartäuserklöster im Kanton aufzuheben, um die beschlagnahmten Güter dem Bischof und den kirchlichen Institutionen der Stadt zukommen zu lassen, die in Schwierigkeiten steckten.
Zwei Jahrhunderte lang widersetzte sich der Pontifikatsstaat dieser Forderung, gab aber schließlich dem Druck der Regierung nach und gewährte 1778 die Aufhebung. Die Mönche von Valsainte wurden daraufhin ins Kartäuserkloster Part-Dieu bei Bulle geschickt, und alle Güter gingen in die Hände des Kantons Freiburg über, der das Kloster schloss.
Während der Französischen Revolution wurde das Kartäuserkloster zeitweise Zufluchtsort für die Trappistenmönche und später für die Redemptoristen, danach wurde es verlassen und verfiel. 1848 wurde das Kartäuserkloster Part-Dieu ebenfalls aufgehoben. 1861 versuchten die ehemaligen Mönche von Part-Dieu, die wieder zur Gemeinschaft zugelassen wurden, ihren Sitz zurückzugewinnen, was jedoch nicht möglich war. Somit wandten sie ihre Aufmerksamkeit dem Kartäuserkloster Valsainte zu.
Sie konnten sowohl den Teil besetzen, der mittlerweile in Privatbesitz war, als auch einen Teil der alten Anlage und den nördlichen Teil des Gebäudes. Der Staat schenkte ihnen die Hälfte der Kirche, die als Kapelle für die Einheimischen diente (die andere Hälfte war fast in Trümmern) sowie den südlichen Teil des Gebäudes. So wurde das Kloster auf seinen eigenen Fundamenten wiederaufgebaut. Das klösterliche Leben nahm 1863 regulär seinen Lauf und wurde seitdem nicht unterbrochen.
1861 wurden die Geistlichen aus Frankreich mit Ausweisung bedroht, und um sie aufzunehmen, wurde ein neuer Bereich mit 7 Zellen und einem neuen Gebäude errichtet. Die Vertreibung erfolgte 1901 in einem solchen Ausmaß, dass weitere Zellen gebaut und die Kirche, das Refektorium sowie die Klausur erweitert werden mussten. Heute kann das Kartäuserkloster Valsainte 38 Patres und 25 Brüder beherbergen, und das Innere der Kirche wurde 1971 restauriert.
Das Kartäuserkloster Valsainte gehört zum Orden, der von S. Bruno im 11. Jahrhundert in den Bergen der Chartreuse bei Grenoble gegründet wurde. Der Kartäuser lebt als Einsiedler, obwohl er mit seinen Mitbrüdern zusammenlebt. Den Großteil der Zeit verbringt er in seinem Zimmer, das in der Regel aus einer Zelle und einem Garten besteht. In Valsainte befindet sich die Zelle der Mönche jedoch auf zwei Ebenen und ist in verschiedene Bereiche unterteilt: einen für geistliche Übungen, einen anderen für das Studium, zudem gibt es eine kleine Werkstatt für manuelle Arbeit und ein Zimmer zur Ruhe. Jeder Mönch verfügt somit über einen sehr großzügigen Raum, um sich sowohl körperlich als auch geistig auszubreiten.
