Первоначальное собрание египетских древностей было уже во Флоренции в XVIII веке, в коллекциях Медичи, но в XIX веке оно значительно увеличилось благодаря великому герцогу Тосканы Леопольду II, который, помимо покупки нескольких коллекций, финансировал вместе с Карлом X, королем Франции научную экспедицию в Египет в 1828 и 1829 годах. Экспедицию возглавляли Жан-Франсуа Шампольон, расшифровщик иероглифов, и пизанец Ипполито Роселлини, который стал отцом итальянской египтологии и был другом и учеником Шампольона.
Многочисленные предметы, собранные в ходе путешествия, как в результате археологических раскопок, так и скупки находок у местных торговцев, были поровну разделены по возвращении между Лувром в Париже и Флоренцией.
В 1855 году был официально основан Египетский музей во Флоренции, а в 1880 году пьемонтский египтолог Эрнесто Скиапарелли, будущий директор Египетского музея в Турине, был назначен ответственным за перенос и упорядочивание египетских древностей в нынешнем здании вместе с Археологическим музеем: под руководством Скиапарелли флорентийские коллекции получили значительное пополнение.
Последняя группа экспонатов, поступивших в Египетский музей во Флоренции, состоит из пожертвований от частных лиц и научных учреждений: особенно стоит отметить находки, подаренные Флорентийским папирологическим институтом, происходящие из раскопок, проведённых в Египте в 1934-1939 годах.
В настоящее время Египетский музей во Флоренции насчитывает более четырнадцати тысяч экспонатов, размещённых в девяти почти обновлённых залах и двух хранилищах: коллекция включает материалы от доисторического периода до коптской эпохи, с выдающимися собраниями стел, сосудов, усхабти, амулетов и бронзовых фигурок разных эпох.
Среди множества важных и интересных объектов стоит отметить несколько статуй эпохи Аменхотепа III, колесницу XVIII династии, столб гробницы Сети I, фаянсовый кубический кубок, погребальный инвентарь кормилицы дочери фараона Тахарки, портрет женщины из Фаюма, коллекцию тканей коптской эпохи, а также важное собрание гипсовых слепков конца XIX века. Египетский музей во Флоренции – Виа делла Колонна, 38 – Флоренция
