O museu, criado a partir da divisão do Gabinete de Ciências da Universidade promovida por Carlo Farini em 1860, está localizado na sede atual – no Instituto Universitário de Zoologia – desde 1933. Os espécimes exibidos, cerca de oito mil entre vertebrados e invertebrados, provêm em parte das coleções de Aldrovandi, Cospi e Marsili, e em parte estão ligados às diferentes fases de ampliação do museu. A montagem, enriquecida com dioramas, aprofunda temas específicos (os parques nacionais, a caça e os animais extintos ou em extinção).
É, tanto em superfície quanto em coleções expostas e conservadas, um dos museus zoológicos mais importantes da Itália. Introduzido por uma visita aos parques nacionais de Abruzzo e do Gran Paradiso, por meio de dioramas (entre os primeiros concebidos a nível nacional), o percurso expositivo propõe uma série de seções temáticas. São particularmente interessantes as dedicadas, respectivamente, à caça (ilustrada tanto pelas técnicas de captura e reconhecimento das trilhas, o trabalho com peles e outras atividades relacionadas quanto pela presença dos “troféus”) e aos animais extintos ou em extinção. Não menos importante é a seção que ilustra o progresso da complexidade organizacional nos vários grupos animais.
Extensíssimo é o repertório de espécimes presentes no setor ornitológico do museu. O Instituto de Zootecnia, que fica a curta distância do museu, conserva ao longo do corredor de entrada três vitrines com espécimes taxidermizados de avifauna de criação, aves domésticas, pombos e alguns achados e modelos relativos à cunicultura. As coleções entomológicas e malacológicas foram objeto de reorganização e ampliação.
