O Museu está situado entre o coro e a sacristia da Igreja de São Domingos. Foi criado pelo Prior e pela Superintendência das Galerias em 1956 para reunir as obras que até então estavam na igreja e no convento.
No andar inferior encontram-se obras que vão do século XIV ao XVIII, incluindo o Casamento Místico de Santa Catarina de Filippino Lippi, o Crucifixo de Giunta Pisano, São Tomás de Guercino. Também se destaca um manuscrito coral iluminado do século XIV e preciosos relicários, entre eles o de São Tomás de Aquino do século XV e o dedo de São Luís da França do século XIII.
No salão superior estão vários ornamentos religiosos, como castiçais, incensários, cálices e um baldaquino do século XVII que, junto com o Manto da Madonna do Rosário, foi oferecido em voto pelos bologneses à Bem-Aventurada Virgem do Rosário, em 1630, pela cessação da peste.
No salão superior encontram-se vários ornamentos religiosos, como castiçais, incensários, cálices e um baldaquino do século XVII que, junto com o Manto da Madonna do Rosário, foi oferecido em voto pelos bologneses à Bem-Aventurada Virgem do Rosário, em 1630, pela cessação da peste.
