Коллекция Музея этномедицины Скарпа организована по диахроническому принципу, начиная с самых древних медицинских систем и доходя до современных народных традиций, при этом уважая хронологию маршрутов, пройденных Скарпой с 1938 по 1992 год.
Некоторые витрины тематические и детально рассматривают конкретные вопросы, которые в некоторых случаях превратились в самостоятельные дисциплины. Экспозиция из более чем 1500 предметов часто дополняется обширными подписями, библиографическими ссылками и отсылками к проведённым исследованиям, всё это с целью создать образовательную выставку. Если неподготовленный посетитель может получить полезные подсказки, чтобы понять, что такое этномедицина, то знаток темы найдёт множество следов и рекомендаций для изучения и развития новых исследовательских тем.
Предметы, инструменты, лекарства, фотографии (с указанием времени и места) документируют, с точки зрения А. Скарпы, стратегии здравоохранения или отдельные профилактические и лечебные практики, применяемые многочисленными и разными этническими группами. Это ценный свидетельственный материал медицинских знаний, находящихся на грани исчезновения, путешествие во вселенную исторического человека под видом медицины. Таким образом, главная цель — сбор и архивирование.
В то же время подчеркивается актуальность некоторых терапевтических решений, обращая внимание специалистов на «активные принципы» или на простые, но эффективные методы, которые, каким бы «странными» они ни казались, заслуживают внимания хотя бы потому, что появились в результате вековых наблюдений и экспериментов.
С этим музеем, уникальным в своём роде в мире, А. Скарпа заполнил пробел в знаниях и развитии этномедицины, в вере, что это приведёт к лучшему пониманию и признанию вклада «традиционных практик» в прогресс всех тех наук, которые стремятся облегчить человеческие страдания.

