О первой версии дворца нам оставил ценные документы Пьер Паоло Рубенс, включив гравюру фасада в книгу “Палаццо ди Генова”, опубликованную им в Антверпене в 1622 году.
Благодаря этому задокументировано первоначальное соединение между двумя крыльями дворца с открытым лонжатыпом, закрытым в середине XVII века и, на уровне второго этажа, с террасой, на которой в 1734 году была построена галерея зеркал. Также виден оригинальный фресковый декор с имитацией архитектурных элементов, недавно были обнаружены некоторые фрагменты, из которых следует, что существует непрерывность оформления между внешними фасадами и фресковым декором в залах первого парадного этажа. Музей возник вместе с коллекцией картин, мебелью, керамикой, серебром, книгами и гравюрами, которые маркизы Паоло и Франко Спинола подарили в 1958 году итальянскому государству вместе с многовековым дворцом семьи, который составлял его наследие. Условием пожертвования было сохранение облика резиденции, который его характеризовал, за исключением последних двух этажей.
Здесь, осознавая, что разрушения войны стерли исторический облик и, следовательно, это условие потеряло смысл, предложили оформить музей иного рода — тогда еще создаваемую Национальную галерею Лигурии.
Как и предполагалось, эта часть дворца была открыта в 1993 году для презентации публике ядра произведений, которые сегодня обогащают коллекцию музея за счет приобретений государства, направленных на дополнение дарения Спинола.
