Ele é formado por três grandes corpos de edifício que incorporaram e unificaram construções anteriores: a ala voltada para o Bacino di San Marco (que contém a Sala do Maggior Consiglio) e que é a mais antiga, reconstruída a partir de 1340; a ala voltada para a Praça (antigo Palácio da Justiça) com a Sala do Scrutínio, cuja realização nas formas atuais começa a partir de 1424; No lado oposto, a ala renascentista, com a residência do doge e muitos escritórios do governo, reconstruída entre 1483 e 1565.
A entrada para o público do Palácio Ducal é a Porta del Frumento, (assim chamada porque havia ao lado o “Ufficio delle Biade”) que se abre sob o pórtico da fachada trecentista voltada para o Bacino San Marco. No térreo estão os serviços ao público e o Museu da Opera; a área das antigas cozinhas do Doge, que hoje abriga também a cafeteria, está equipada para acolher exposições temporárias.
O percurso para as salas superiores do palácio passa primeiramente pelo extraordinário pátio, segue pelo Piano delle Logge e com a visita aos preciosos quartos do Apartamento Ducal, no primeiro andar, e das Salas Institucionais que se desenvolvem entre o segundo andar e o piano delle Logge, para terminar com a visita à Armeria e às Prisões.
Esses são os itinerários propostos pelo Museu, que não seguem linearmente os andares individuais do palácio, mas delineiam no seu interior um percurso que sobe e desce atravessando-os várias vezes. A numeração das salas indicada aqui segue a mesma ordem. Existem também os Itinerários Secretos, que não fazem parte do percurso normal do Palácio, sendo visitáveis apenas em condições especiais.

