Vertelt over een “plek” zwevend tussen water en land die door de eeuwen heen is veranderd en getransformeerd door natuurlijke verschijnselen en menselijke acties. Een route die begint bij vondsten die de intensieve handelsuitwisselingen aantonen die de lagune en haar bewoners al in de Myceense tijd (2e millennium v.Chr.) omvatten, en zich uitstrekt over Venetiaanse, pre-Romeinse en Romeinse, Byzantijnse en hoogmiddeleeuwse getuigenissen en de glorieuze tijden van de Serenissima doorkruist tot aan de 19e eeuw.
De Archeologische Afdeling verzamelt vondsten uit de lagune en het Altino-gebied, aangevuld met objecten uit particuliere collecties, zoals de verzameling Egyptische beeldjes van brons en keramiek, die een tijdsspanne beslaan van het paleolithicum tot de late Romeinse tijd. Uitgebreid is de collectie Griekse, Italiaanse en Etruskische keramiek uit de 7e tot de 4e eeuw v.Chr. met verschillende decoratieve stijlen en productietechnieken.
De Romeinse keramiek bestaat uit een kleine maar belangrijke kern: kook- en tafelgerei voor funerair gebruik, glazen en bekers, diverse typen olielampen. Voor cultisch en funerair gebruik zijn er prehistorische bronsfiguren van menselijke en dierlijke vorm uit Etruskische, Italiaanse en Paleovenetische productie, daarbij aansluitend persoonlijke en sierobjecten zoals fibulae en spiegels. Romeinse bronzen beeldjes met een heilige aard van huiselijke lararia en tafelgerei en gebruiksvoorwerpen, evenals gegraveerde platen en antefixen afkomstig van heiligdommen in Midden- en Zuid-Italië.
Kleine Griekse beeldhouwwerken kwamen via Venetiaans verzamelen naar Torcello. Romeinse kopieën en herwerkingen van Griekse originelen, grafmonumenten en portretten uit het Altino-gebied, urnen en cippi maken de beeldhouwkundige collectie van de archeologische afdeling compleet.
De Middeleeuwse en Moderne Afdeling toont werken en documenten gedateerd van de 6e eeuw tot de 19e eeuw. Steenmaterialen en architectonische fragmenten getuigen van diepe culturele en artistieke banden met het Byzantijnse rijk, zowel met aanwezigheid van in het oosten geproduceerde werken, zoals de prachtige doopvont uit de 6e eeuw of de verzameling encolpia, medailles en bronzen fibulae, als met het voortbestaan en hergebruik van Byzantijnse decoratiemodellen in lokaal vervaardigde objecten. Uit de basiliek van Torcello zijn fragmenten van de muurbekleding van voortreffelijke kwaliteit en het altaarstuk in verguld zilver uit de 13e eeuw naar het museum overgebracht, een zeldzaam overblijfsel, zij het onvolledig, van een kerkelijk interieur dat in de lagune wijd verspreid was.
Houten beeldhouwwerken uit de lagune, Byzantijnse iconen en borduursels uit de 14e en 15e eeuw met heilige onderwerpen vinden hun mooiste voorbeelden in het meerkleurig en verguld bas-reliëf dat een “Pietà” voorstelt en in het paneel met de Kruisiging dat duidelijke Toscaanse invloeden toont. Van Torcello verdwenen kerken is er herinnering in de Aankondiging, de Aanbidding der Wijzen, de Monochromen met verhalen over de Maagd en de verhalen over Santa Cristina van de werkplaats van Veronese, afkomstig uit de kerk van Sint Antonius te Torcello.
Van het sociale en productieleven van Torcello en de nabijgelegen nu ondergelopen eilanden resteert de echo in fragmenten van alledaagse keramiek, munten, glaswerk, kookdriepoten en fabrieksafval, herinnering aan werkplaatsen en actieve ovens.
