この博物館は、15世紀の建物であり1875年に改装されたサンタ・マリア・デッラ・モルテ病院の宮殿に収蔵されており、1881年に創立されました。設立は、ルイジ・フェルディナンド・マルシリ（1714年設立の科学アカデミーの「古代の部屋」の系譜を継ぐ大学博物館）と、最近画家ペラージオ・パラジの膨大なコレクションと、19世紀後半から20世紀初頭にかけてボローニャ及び周辺地域で行われた発掘調査からの多数の出土品を加えた市立博物館との合併によるものです。
アルドロヴァンディ、コスピ、マルシリの大学コレクション、画家ペラージオ・パラジの豊富な収集品、ボローニャ及びその周辺地域での発掘からの考古資料によって構成されており、イタリアで最も重要な収集の一つに位置付けられています。
エジプトコレクションはヨーロッパでも屈指の重要性を持っており、歴史的なコレクションの中でも、エトルリア・イタリアコレクションと、展示ルートで紹介されるポンペイの画家たち展の資料も含むローマコレクションに並んで注目されます。また、アテネのアクロポリス入口に紀元前5世紀に置かれていたフィディアスの青銅像のローマ時代の大理石コピーであるアテナ・レムニアの頭部を所蔵しているギリシャコレクションも特筆に値します。
豊富なボローニャ考古資料は更新世からローマ時代までの都市および周辺地域の最古の歴史を示し、特にエトルリア文明の遺物は博物館の中心的存在で、数千点の墓葬品を通じて紀元前9世紀から4世紀初頭までのエトルリア名フェルシナ（ボローニャの古称）の発展を物語っています。
また、紀元前189年にラテン植民地として設立されたローマ時代のボノニアの生活もよく示されており、柱石、建築装飾の残骸、そして特に多数の墓碑が入口ホールや中庭に配置され、共和政・帝政期の街の暮らしを生き生きと映し出しています。現在の中心街で発掘された劇場の装飾は、無頭のネロ像に関連付けられています。
博物館の収集の中には、10万点を超える硬貨、メダル、刻印、鋳型からなる国内でも重要な貨幣コレクションや、ギプソテカも含まれます。
この博物館の資産は主に、先史時代からローマ時代までのボローニャの考古学を示す豊かな資料群に構成されており、中でもヴィッラノヴァ文化とフェルシナ文化のエトルリア時代の多数の墓葬品が際立っています。現在、オリジナルの展示を大幅に刷新された収蔵品は、パラジおよび大学のコレクションに由来する展示室（エジプト、ギリシャ、エトルリア・イタリア、ローマ）と、都市の歴史を示すセクション（先史時代、エトルリア、石碑）があり、特にエジプトセクションには約3500点の作品が収められ、ホレムヘブ王の墓のレリーフなどの傑作を含み、ヨーロッパでも有数のコレクションです。
また、重要な貨幣コレクションとして約10万点の硬貨やメダルがあります。先史時代のセクションでは、最近刷新された展示において、更新世の石器類、続く新石器時代、銅器時代、青銅器時代の発展を表す多くの人工物が並びます。ファルネート洞窟の証拠や、紀元前16世紀のロッカ・ディ・バドロロの隠し場所から発見された41個の青銅の斧、複数の居住跡からの出土品、特にトスカネッラのサン・ジュリアーノの遺跡からは、良好な状態の鎌の鋳型や矢じりが含まれています。展示の特徴は非常に豊富なエトルリアコレクションで、ヴィッラノヴァ期のボローニャ（紀元前9世紀から6世紀半ば）を示す約4000の墓葬品が多彩に展示されています（例：サヴェーナ、サン・ヴィターレ、ベナッチ、アルノアルディの墓地など）。そこには日用品、青銅の道具、陶器や青銅の器が含まれ、特に有名なベナッチのアスコスや、同名の聖フランチェスコ教会付近で発見された約1万4千点の青銅器を含む鋳造場遺跡「サン・フランチェスコの隠し場所」が際立っています。
フェルシナの完全な都市期であるエトルリア期（「チェルトーザ」またはフェルシナ期）も主に墓葬品によって示されており、「大きな墓」と「スツールの墓」がマルゲリータ庭園の墓地に属します。チェルトーザの墓地からは、軍事、民事、宗教の場面が飾られた重要な青銅製のガラスも発見されています。また約250点の砂岩彫刻の石碑群は、もっとも格式高い墓地の標識として重要です。ロマーニャの鉄器時代初期の主要遺跡ヴェルッチョのヴィッラノヴァ文化には、豪華な木製副葬品を備えた王族の墓が展示されています。ローマ時代に関しては、劇場跡（チェレスティーニ広場）で17世紀に発見されたネロ皇帝の大理石トルソが入口ホールに展示され、入口ホールと中庭には紀元前1世紀から1世紀のほとんどの墓碑が配されており、名前（オノマスティック）や職務についての資料、そして故人の職業を描いた装飾が興味深い資料となっています。中庭にはエミリア街道からのいくつかのマイルストーンも配置されています。
収集品由来のセクションに移ると、エトルリア・イタリア古代物品の部屋ではブッケリ焼きや、有名な「コスピアーナ皿」などの鏡が目立っています。ギリシャのセクションにはパラジコレクションの有名な大理石のアテナ・レムニアの頭部が展示されており、これはフィディアスの青銅像の美しいローマ時代の複製です。ギリシャおよびマグナグレキアの陶器、宝石、金銀細工が豊富に揃っています。特にエジプトコレクションはヨーロッパで最も重要なものの一つで、主にパラジ寄贈品で3,000点を超え、最近再構成されました。棺、石碑、ウシャブティや多様な工芸品など、三千年の文明を伝えています。重要な作品として、サッカラのホレムヘブ王の墓（紀元前13世紀）からのレリーフがあり、最近の発掘で再発見され、これに関連したコンピュータグラフィック映像も上映されています。博物館にはパソコン端末があり、来訪者が豊かな遺産の様々な面やテーマを探求・深掘りできる情報セクションを備えています。
展示室は1階にあり、約1000平方メートルのスペースで、大規模な展覧会に対応可能です。過去40年間には、博物館主催または他のパートナーと共催の数百回にわたる特別展がここで開催されました。
また、教育プログラムの質と継続教育にも定評があり、博物館教育の重要な拠点となっています。
最後に、歴史・科学研究活動に関連した国内外の多数の機関との連携も、博物館の恒久的な資産の価値向上に不可欠であり、多くのプロジェクトや貸出業務に毎年携わっています。
