Avec une surface d’exposition de 850 mètres carrés, le musée occupe l’étage supérieur du bâtiment qui abrite le Département des Sciences de la Terre. Le site actuel a été voulu et conçu par le professeur Luigi Bombicci, premier titulaire de la chaire de Minéralogie de l’Université de Bologne, créée en 1860, et directeur du musée correspondant qui lui doit la majeure partie de ses matériaux, constitués entre 1860 et 1903.
Dans l’ensemble, il s’agit de plus de 50 000 échantillons de minéraux et de roches du monde entier d’une importance historique et scientifique notable. Environ 10 000 pièces sont exposées, réparties en différentes collections générales ainsi qu’en collections et expositions thématiques ; d’un intérêt particulier sont celles qui documentent les aspects géo-minéralogiques du territoire bolonais ; les plus de 150 météorites, parmi lesquelles on note la rare « chondrite carbonée » de Renazzo ; plus de mille magnifiques ambres siciliennes ; 650 marbres anciens ; les pierres dures et locales ; les anciens instruments scientifiques.
