Com uma área de exposição de 850 metros quadrados, o museu ocupa o andar superior do edifício que abriga o Departamento de Ciências da Terra. A sede atual foi idealizada e concebida pelo prof. Luigi Bombicci, primeiro titular da cátedra de Mineralogia da Universidade de Bolonha, instituída em 1860, e diretor do respectivo Museu, que lhe deve a maior parte de seus materiais, constituídos entre 1860 e 1903.
No total, são mais de 50.000 amostras de minerais e rochas de todo o mundo de notável importância histórica e científica. As peças expostas são cerca de 10.000, divididas em várias coleções gerais, bem como em grupos e exposições temáticas; de especial interesse aquelas que documentam os aspectos geo-mineralógicos do território de Bolonha; os mais de 150 meteoritos, entre os quais se destaca a rara ‘condrita carbonácea’ de Renazzo; as mais de mil lindas âmbares sicilianas; os 650 mármores antigos; as pedras duras e locais; os antigos instrumentos científicos.
