Com uma área de exposição de 850 metros quadrados, o museu ocupa o andar superior do edifício que abriga o Departamento de Ciências da Terra. A sede atual foi idealizada e criada pelo prof. Luigi Bombicci, primeiro titular da cadeira de Mineralogia da Universidade de Bolonha, instituída em 1860, e diretor do respectivo Museu, que deve a ele a maior parte de seu acervo, formado entre 1860 e 1903.
No total, são mais de 50.000 amostras de minerais e rochas de todo o mundo de grande importância histórica e científica. As peças expostas são cerca de 10.000, divididas em diversas coleções gerais, bem como em coleções e exposições temáticas; de particular interesse são aquelas que documentam os aspectos geo-mineralógicos do território de Bolonha; os mais de 150 meteoritos, entre os quais se destaca a rara ‘condrita carbonácea’ de Renazzo; as mais de mil belas âmbar sicilianas; os 650 mármores antigos; as pedras duras e paesinas; os antigos instrumentos científicos.
