国立医学図書館は1925年1月31日に設立され、医学各分野からの文献資料を収集するという法定の任務を負いました。図書館の設立は、文部省、ローマ王立大学、およびサン・スピリト慈善病院管理局によって署名されました。
1925年2月26日の開館式では、ヴィットリオ・アスコリ教授が、この図書館をウンベルト1世総合病院の研究目的に不可欠な補完であると紹介しました。
図書館は1975年まで文部省の管轄下にありました。1975年に文化・環境資産省が設立されると、その管轄に移され、元の性格を保ちました。
初期の文献コレクションはランチジアーナ図書館、医学協会、アレクサンドリナ図書館の蔵書から成り立ち、カジミーロ・マナッセイ、ルイジ・ガラッシ、フェリーチェ・ラ・トッレなど著名な学者の寄贈でさらに充実しました。
スペース不足のため、古い資料は外部の倉庫に保管されています。
図書館は各医学分野の統合と更新に努め、医科大学の試験用マニュアルも取得しようとしました。2016年に図書館はローマ国立中央図書館の施設に移転しました。
