罗马萨皮恩扎大学矿物博物馆由教皇庇护七世于1804年11月13日通过通告《Uberes dum menti nostrae》成立，并于1806年在其最初的尊贵馆址——当时为大学所在地、现为国家档案馆的萨皮恩扎宫开幕。
首任馆长是杰出的矿物学家卡洛·朱塞佩·吉斯蒙迪神父（1762-1824），正如莱昂哈德勋爵为表彰他而命名的新矿物质——称为吉斯蒙迪石的沸石所示。吉斯蒙迪负责收购了维罗纳矿物学家卡米洛·基耶里奇的藏品，这成为了博物馆收藏的基础，并编写了第一个系统且详尽的藏品目录。
真正的“博物馆之父”是矿物学家乔瓦尼·斯楚弗（1842-1915），他发现了塞拉石和加斯塔尔石，他的杰出学生费鲁乔·赞博尼将“斯楚弗石”命名以纪念他。斯楚弗在博物馆任职期间，又增添了1万件藏品，这些藏品来自拉齐奥、埃尔巴岛和皮埃蒙特阿尔卑斯山的采集活动，以及贸易和精明购买。
他去世时，博物馆藏品中已有896种矿物，几乎涵盖了当时已知的900种矿物，还包括几乎所有的意大利陨石。如今，藏品超过3万件矿物标本（共2500种矿物）、陨石和宝石，无疑是欧洲最重要的收藏之一。自由参观免费。
