По заказу богатой семьи Lavezzola в период с 1530 по 1550 годы гениальному архитектору Michele Sanmicheli был построен этот музей, который впоследствии стал собственностью семьи Помпей. В 1833 году граф Alessandro Pompei передал его муниципалитету Вероны для размещения выставок, художественных коллекций и научных собраний большого престижа и значения для города. Первоначальное ядро здания было расширено, начиная с 1858 года, посредством присоединения прилегающих зданий и домов.
В просторных залах дворца сегодня размещены четырнадцать выставочных залов, библиотека, лаборатории, хранилища коллекций и офисы Музея.
Городской музей естественной истории Вероны содержит научные отделы, посвящённые изучению минералов и пород, палеонтологии и зоологии. Отделы доисторического периода и ботаники размещены в здании Командного поста австрийского Арсенала в Вероне.
Научные материалы, собранные исследователями Музея и многочисленными натуралистами за почти пять столетий, сегодня тщательно подготавливаются и каталогизируются, изучаются и затем сохраняются в коллекциях или выставляются для публики в залах.
Музей играет центральную и определяющую роль в научных исследованиях и публикации научных и просветительских трудов. Также очень активен отдел образования и коммуникаций, целью которого является распространение естественнонаучной культуры среди различных групп аудитории (школы, взрослые, семьи, ассоциации и др.).
Одна из секций Городского музея естественной истории Вероны посвящена окамелям Болка: самой замечательной истории эволюции Земли, запечатлённой в скале, подобно страницам книги. Из местности Болка на горе Лессини, в 50 км от Вероны, поступают ископаемые образцы более чем 250 видов животных и 200 видов растений, представляющие захватывающий срез жизни на Земле 50 миллионов лет назад.

