Comissionado pela rica família Lavezzola entre os anos de 1530 e 1550 ao brilhante arquiteto Michele Sanmicheli, tornou-se posteriormente propriedade da família Pompei e, em 1833, o Conde Alessandro Pompei o doou ao Município de Verona para abrigar exposições, coleções de arte e coleções científicas de notável prestígio e importância para a cidade. O núcleo original do palácio foi ampliado, a partir de 1858, com a progressiva anexação de espaços e casas adjacentes.
Nas amplas salas do Palácio hoje encontram espaço quatorze salas expositivas, a biblioteca, os laboratórios, os depósitos das coleções e os escritórios do Museu.
O Museu Cívico de História Natural de Verona abriga seções científicas dedicadas ao estudo de minerais e rochas, paleontologia e zoologia. As seções de pré-história e botânica estão alojadas na Palazzina Comando do Arsenal Austríaco de Verona.
O material científico reunido pelos pesquisadores do Museu e por muitos naturalistas ao longo de quase cinco séculos é hoje meticulosamente preparado e catalogado, estudado e então conservado nas coleções ou exposto ao público nas salas.
O Museu desempenha assim um papel central e determinante na pesquisa científica e na publicação de ensaios e textos divulgativos. Muito ativa também é a seção de educação e comunicação que tem como objetivo a divulgação da cultura naturalista entre os diversos grupos de público (escolas, adultos, famílias, associações, etc.).
Uma seção do Museu Cívico de História Natural de Verona é dedicada aos fósseis de Bolca: a mais extraordinária evidência da evolução da Terra impressa na rocha como nas páginas de um livro. Da localidade de Bolca, nos Montes Lessini, a 50 km de Verona, provêm exemplares fósseis de mais de 250 espécies animais e 200 vegetais, um fascinante recorte da vida na Terra há 50 milhões de anos.

