É um Museu dedicado à história da Irmandade. As salas, dedicadas a uma exposição permanente, abrigam objetos e imagens relativos a quase 8 séculos de vida da Confraria. Desenhos, aquarelas, pinturas, objetos sagrados da escola florentina e objetos ligados à tradição: como a veste preta, o livro com os primeiros capítulos, os urnários usados para as votações, o cesto (zana), os caixões, as primeiras macas com as quais antigamente os doentes eram transportados.
O Museu é uma pequena joia também graças à dedicação e ao empenho de alguns confrades que trabalham em sua contínua melhoria e ampliação.
O edifício na praça do Duomo, doado pelos Medici, contudo, guarda também outras preciosas obras que fazem do nosso patrimônio artístico uma pequena joia para a nossa cidade.
Uma Madonna de Ghiberti, a magnífica composição de Andrea della Robbia, que domina o altar do Oratório, o belo São Sebastião mártir, padroeiro da irmandade, obra do renomado escultor Benedetto da Maiano, e ainda a famosa Madonna della Misericordia, acolhida no suporte de tempietto, sempre no Oratório, de segura escola florentina e especialmente feita para a nossa Companhia.
O Museu revive assim, com seus objetos, a história da Misericórdia mais antiga do Mundo, nascida em 1244.
 e fica dentro da Sede da Misericórdia na Praça do Duomo.){kind=link}