Le couloir par lequel on accède aux quatre chambres du cimetière présente à l’entrée l’inscription Nous étions comme vous et vous serez comme nous. Dans chacune des salles, sont rassemblés les ossements d’environ quatre mille frères morts à Rome sur une période allant du XVIe siècle jusqu’en 1870. Les os sont disposés de manière à former des guirlandes et des éléments décoratifs tandis que certains squelettes sont vêtus des habits des frères et placés dans des niches également constituées d’os.
On pense que la réalisation de ces cryptes est due à un Français ayant fui la période de la Terreur au XVIIIe siècle et qui, une fois arrivé à Rome, a voulu ainsi exorciser et symboliquement mettre fin à l’Ancien Régime. D’autres y voient une trace de type maçonnique, tandis qu’il est possible qu’il s’agisse simplement d’une œuvre des capucins comme avertissement sur la brièveté de la vie et du corps. On dit aussi que la terre située sur le sol des chambres provient de la Terre Sainte.
