Открытый в 1967 году в Дворце Наук на ЭУР с целью обеспечения Рима археологическим музеем постклассического периода и стимулирования исследований этого стратегического периода в изучении трансформации древнего мира, Музей представляет материалы, датируемые IV–XIV веками, в основном из Рима и центральной Италии.
К позднеримскому периоду (IV–VI вв.) относятся три императорских портрета, несколько эпитафий посвящения и захоронения, а также ценная золотая брошь-балиста с ажурным орнаментом. Следующими идут свидетельства лангобардского заселения в Умбрии и Марке (VI–VII вв.) с двумя крупнейшими некрополями центральной Италии (Ночера-Умбра и Кастель-Трозино), которые являются ядром коллекции с их вооружением, ювелирными изделиями, изделиями из слоновой кости, стеклом, бронзовой и керамической посудой.
Последующий каролингский период представлен значительной группой мраморных рельефов из архитектурного декора церквей Рима и Лацио, глубоко обновленных во время «каролингского возрождения» (IX–X вв.). В тот же период относятся мебель и предметы обихода, найденные в двух аграрных хозяйствах папского основания — домускультах Святой Корнелии и Святой Руфины, созданных в Римской Кампании для снабжения города (конец VIII–X вв.) и просуществовавших с другими функциями до позднего Средневековья.
Экспозиция завершается коптской коллекцией, состоящей из рельефов и тканей, которые дают яркое представление о художественном производстве позднеантичного и раннесредневекового Египта (V–X вв.).
В Музее также представлена выдающаяся инкрустация из opus sectile (интарсия из цветного мрамора), украшавшая представительский зал монументальной домус за воротами Марина в Остии.
