Atribuída a Pietro Fiorini, a igreja foi construída a partir de 1575 e consagrada em 1588. Anexa ao Convento das Dominicanas, apresenta-se com uma fachada simples na via Sant’Isaia, perfeitamente inserida no tecido urbano graças ao pórtico colocado em continuidade com o dos edifícios vizinhos. O aspecto fastuoso e espetacular do interior deve-se a uma “modernização” do aparato ornamental e pictórico realizada por volta de meados do século XVIII pelo “quadraturista” Pietro Scandellari e pelos artistas Nicola Bertuzzi e Tertulliano Taroni.
Da mesma época remonta a transformação das serlianas e dos óculos do século XVI na elevação central em janelas retangulares. Em 1799, após a supressão das ordens religiosas decretada pelo governo napoleônico, a igreja de São Matias foi isolada do convento, desacralizada e transformada em depósito.
A restauração, iniciada em 1981 e concluída em 1994, totalmente custeada pelo Ministério dos Bens e das Atividades Culturais, revelou o que restava dos estuques e afrescos. Entregue à Direção Regional dos Bens Culturais e Paisagísticos da Emilia Romagna pela Agência do Patrimônio, a igreja de São Matias tornou-se sede de exposições, encontros, congressos dedicados à arquitetura, ao urbanismo, ao design e ao estudo do patrimônio histórico-artístico-paisagístico do território da Emilia-Romagna.
