Foi fundado em 1928 pelo padre Leonardo Montalti de Mercato Saraceno que, após visitar vários conventos das províncias capuchinhas de Bolonha e da Romagna, reuniu o material mais precioso e mais vulnerável à dispersão com o objetivo de preservá-lo e torná-lo mais acessível. Está localizado em espaços adjacentes ao elegante claustro de Conti (1722) anexo à igreja de São José.
São conservadas cerca de cem pinturas e diversos objetos litúrgicos provenientes de igrejas e conventos de várias localidades da Emília e Romagna, entre os quais figuram obras de Pietro Lianori, Marco Zoppo, Innocenzo da Imola, Prospero Fontana, Calvaert, Cesi, Passerotti, Faccini, Scarsellino, Bononi, Cantarini, Franceschini, Crespi, Gandolfi, Calvi. Entre as obras modernas (séc. XX), trabalhos de Majani e Brindisi. Entre as esculturas, merecem destaque os grupos plásticos de Zaccaria Zacchi de Volterra (séc. XVI), Mazza, Piò, Rossetti.
