Le climat est thermo-méditerranéen subhumide (précipitations annuelles moyennes 732 mm, température moyenne annuelle 18 °C). L’aire est divisée en Hortus Generalis (13 000 m²), qui rassemble principalement des plantes exotiques, et Hortus Siculus (3000 m²), destiné à la culture d’espèces spontanées siciliennes.
L’Hortus Generalis, de style formel ou à l’italienne, est divisé par des allées orthogonales en vingt-deux secteurs géométriques délimités par de larges marches en pierre calcaire taillée ; la régularité des formes est accentuée par la présence de trois bassins circulaires, utilisés pour la culture des plantes aquatiques.
L’Hortus Siculus, avec sa collection de plantes spontanées de l’île, constitue un secteur particulier. Une récente restructuration a permis la création de zones diversifiées dans lesquelles ont été reproduits certains milieux typiquement méditerranéens (milieu dunaire, rocailles, milieux humides, forêt et maquis méditerranéen). Dans ces milieux, aux côtés de plantes communes et répandues, on trouve des espèces particulièrement rares en Sicile.
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