Albergada en el Oratorio de los Girolamini, contrariamente a las costumbres de las órdenes monásticas, que no admitían al público en sus bibliotecas, el Instituto desde 1586 estuvo abierto al público.
La Biblioteca es una de las más ricas del Sur y la más antigua entre las napolitanas, frecuentada durante mucho tiempo por Giambattista Vico. En 1727 los padres oratorianos, por consejo de Vico, compraron la Biblioteca de Giuseppe Valletta que incluía una rica colección de textos jurídicos, filosóficos, religiosos y literarios del siglo XVII y XVIII napolitano.
La Biblioteca, que depende del Ministerio para los bienes y actividades culturales, está ubicada en cuatro magníficas salas del siglo XVIII y dos modernas del extraordinario complejo monumental de los Girolamini.
Cuenta con un patrimonio bibliográfico de aproximadamente 159.700 unidades entre volúmenes y opúsculos, entre los cuales 137 impresos musicales, 5.000 ediciones del siglo XVI, 120 incunables, 10.000 ediciones raras y de valor, 485 periódicos, una cantidad aún no determinada de microfilms y retratos.
Diversos son los fondos que han enriquecido el patrimonio del instituto, entre ellos 5.057 volúmenes del Fondo Agostino Gervasio, cuyos textos tratan sobre arqueología, numismática, bibliografía y literatura clásica; el Fondo Filipino, principalmente de historia eclesiástica, escrituras sagradas y teología; el Fondo Giuseppe Valletta, que contiene ediciones raras del siglo XVI y XVII constituidas por clásicos latinos y griegos, historia y filosofía; y los 940 volúmenes del Fondo Valeri que se refieren a la historia de Nápoles y del sur de Italia.
