Der Erste Saal ist der Ausstellung der Papyrusrollen und der Darstellung von Aspekten, Problemen, Themen und Momenten der Geschichte der Papyrologie gewidmet. Die Materialien sind in fünf Vitrinen ausgestellt.
Der Saal beherbergt auch eine kleine Sektion zu Herculaneum, in der eine moderne Nachbildung der berühmten Maschine zum Abrollen der herculanischen Papyrusrollen gezeigt wird, die Mitte des 18. Jahrhunderts von dem Pater Scolopius Antonio Piaggio entwickelt wurde. Im Zweiten Saal befindet sich die Bibliothek für Ägyptologie und Papyrologie mit über 1500 Bänden zu ägyptologischen und papyrologischen Themen.
Der Saal beherbergt außerdem zwei Vitrinen: Die erste enthält eine Sammlung antiker Keramik aus dem östlichen Mittelmeerraum und einige moderne Gegenstände, die auf der Müllhalde der archäologischen Mission der University of Michigan in Soknopaiou Nesos gefunden wurden; in der zweiten sind verschiedene Objekte ausgestellt, die in Verbindung mit der Welt der Schrift stehen. Der Dritte Saal beherbergt die Direktion und Verwaltung des Museums. Hinter dem Museum befindet sich das Labor für Lesen und Restaurierung der Papyrusrollen, ausgestattet mit einer Station für optische Analyse.
