La nouvelle installation, suggestive et immersive, dispose d’un dispositif muséographique moderne et original. La complexité des contenus est médiée par une communication à plusieurs niveaux où le visiteur joue un rôle actif et interagit avec un dispositif d’exposition inhabituel et captivant.
Le musée est organisé en trois sections, chacune étant en réalité un musée dans le musée : « Sur les traces de la vie », dédiée aux fossiles et à la paléontologie.
« Collectionner pour étonner, collectionner pour étudier » raconte l’évolution du collectionnisme naturaliste et la naissance de la muséologie scientifique.
« Les stratégies de la vie » illustre la variété des formes vivantes et la complexité des adaptations et spécialisations. Au rez-de-chaussée, la riche bibliothèque scientifique et deux espaces d’exposition importants : la Galerie des Cétacés qui abrite le squelette d’une baleine et d’un jeune cachalot, et l’Aquarium des Tegnùe.

